Las ruinas de una ciudad no constituyen una mera ciudad muerta. Si bien son sus restos, éstos conforman un vivo testimonio de una realidad que trascendió el tiempo. Sus habitantes ya no están pero sus obras permanecen. Son un documento vital y elocuente de lo que fue.  Santa Fe "La Vieja" nos lleva a la presencia misma del escenario de la gesta silenciosa y fecunda de la población del Río de la Plata. Poder verla hoy nuevamente, después de una larga noche de casi tres siglos (1660-1949), es un verdadero privilegio que anida una tradición, cimientos de civilización y la grandeza del esfuerzo y anhelo de quienes fueron sus autores y protagonistas.
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En su interior se pueden apreciar distintos elementos utilizados por los aborígenes de la región como vasijas, armas, herramientas, utensilios de labranza, tijeras, monedas, collares, mates, ladrillos, tejas, canoas y elementos de caza y pesca, contando asimismo con las marcas utilizadas en la primera yerra realizada alrededor de 1576. Fue inaugurado en 1973, año del cuarto centenario de la fundación de Santa Fe.
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Se integra al recorrido del Parque Arqueológico, complementando el itinerario que a través de las calles de la traza fundacional conecta el Museo de Sitio, la Plaza, los restos de iglesias y viviendas, además del paisaje natural de la costa santafesina. La Casa de Vera Muxica es un espacio ambientado interactivo que recrea una casa principal en Santa Fe "La Vieja" durante la primera mitad del siglo XVII. Se propone como un ámbito sintetizador elaborado a partir de testimonios escritos y arqueológicos.
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En el sitio pueden distinguirse dos áreas que tuvieron usos y formas de ocupación diferenciadas: el entorno de la Plaza de Armas, con solares dedicados a usos religiosos, administrativos y viviendas; y la zona de las "cuadras", dedicadas a cultivos urbanos.

El río San Javier ha erosionado el sector próximo a la Plaza, donde se encontraban la Iglesia Matriz, la Iglesia de la Compañía de Jesús, la Iglesia de San Roque y la casa del propio Juan de Garay.

El área actual del sitio de casi 69 hectáreas corresponde a las dos terceras partes de la traza fundacional. En este sector se ubican el remanente de la Plaza de Armas, el Cabildo y  las iglesias conventuales de Santo Domingo, La Merced y San Francisco; ésta última conserva los restos de Doña Jerónima de Contreras, hija de Juan de Garay, y de su esposo Hernando Arias de Saavedra (Hernandarias), gobernador criollo del Río de la Plata y figura ilustre de la historia colonial.

También se pueden apreciar un significativo número de viviendas,  de las construcciones originales se conservan partes bajas de los muros y sus cimientos, construidos con la técnica de tapia o tierra apisonada, además de fragmentos de tejas, algunas de ellas con dibujos e inscripciones.
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